Doctorado en Genómica Integrativa
El programa de Doctorado en Genómica Integrativa busca formar investigadores especializados en el área de la Genómica que desarrollen avances científicos innovadores, competitivos y de alto impacto. La Genómica involucra el entendimiento de la estructura, función, interacción y evolución de la información contenida en el genoma. El concepto integrativo implica entregar una visión holística de los sistemas biológicos.
El programa de doctorado en Genómica Integrativa tiene un carácter académico, en el que los estudiantes recibirán herramientas, habilidades y conocimientos para elegir el mejor modelo y acercamiento experimental que les permita resolver problemas biológicos asociados con las ciencias genómicas, gracias a la variada formación científica y líneas de investigación de los académicos del programa.
Objetivos
Perfil de Ingreso
Perfil de Egreso
Líneas de Investigación
Perfil de egreso
Objetivo General
El Doctorado en Genómica Integrativa busca formar investigadores con sólidos conocimientos y habilidades en las Ciencias Genómicas que puedan proponer y generar proyectos científicos innovadores, basados en el conocimiento y la experimentación.
Objetivos Específicos
- Formar investigadores especializados en el área de las Ciencias Genómicas y sus aplicaciones a través de la generación de avances científicos innovadores, competitivos y de alto impacto a nivel nacional e internacional
- Formar investigadores de excelencia, capaces de integrar los conocimientos de frontera en las Ciencias Genómicas, con sólidos conocimientos en el área de bioinformática.
Perfil de Ingreso
El Programa de Doctorado en Genómica Integrativa está dirigido a profesionales con grado académico de Licenciado o Magíster en Biotecnología, Biología, Bioquímica, Medicina o formación equivalente.
Perfil de egreso
El graduado del programa de Doctorado en Genómica Integrativa de la Universidad Mayor es capaz de:
- Proponer y desarrollar investigación de punta en el área de la Genómica con proyecciones nacionales e internacionales.
- Integrar las distintas áreas de la Genómica para generar conocimientos y avances científicos básicos y aplicados.
- Integrar grupos de investigación multidisciplinarios que permitan abordar los desafíos de la ciencia y la tecnología actual desde una perspectiva sinérgica.
- Conducir proyectos científicos con liderazgo e independencia.
Líneas de Investigación
Las líneas de investigación del programa son las siguientes:
Bases genómicas de enfermedades neurodegenerativas y envejecimiento
Esta línea desarrolla investigación asociada a la identificación y caracterización de genes, vías y redes génicas que participan en el desarrollo de enfermedades neurodegenerativas y envejecimiento. Utiliza organismos modelo tales como Mus musculus y Caenorhabditis elegans, así como estudios en cohortes de pacientes humanos.
Patogénesis, inmunología e interacción microbioma – hospedero
Esta línea busca entender los mecanismos genómicos de interacción entre microorganismos y hospederos, enfocado en invasión y resistencia de patógenos, control y modulación del sistema inmune, como también en el efecto del microbioma en el comportamiento en especies modelo, así como en humanos y en animales de producción intensiva.
Desarrollo y respuesta al ambiente en plantas
Esta línea de investigación busca comprender las redes regulatorias que controlan el desarrollo y la respuesta al ambiente en plantas en modelos como Arabidopsis thaliana, así como en árboles frutales y plantas nativas. En esta línea se utilizan herramientas moleculares y de secuenciación masiva de ADN para su posterior aplicación con fines agronómicos.
Bioinformática y biología computacional
Esta línea de investigación utiliza y desarrolla herramientas bioinformáticas y de genómica computacional con el fin de contribuir al análisis de grandes cantidades de datos, así como responder preguntas transversales a la biología del genoma. Entre estas preguntas se encuentran la identificación de patrones de secuencia en RNA y proteínas, la estructura, función y evolución de macromoléculas; genómica comparativa y evolutiva, como también las huellas genómicas de la adaptación de organismos a distintos ambientes.
Microbiología, ecología y genómica ambiental
Esta línea estudia la diversidad, filogenia, estructura y funcionalidad genómica, y asociaciones entre organismos y su ambiente, utilizando abordajes innovadores de (meta)genómica y (meta)transcriptómica. Se enfoca en los mecanismos ecológicos y evolutivos que permiten el desarrollo y la persistencia de organismos, poblaciones y comunidades en sistemas extremos y el rol de sus genomas y la expresión génica en procesos ecosistémicos.
Estructura curricular
Dr. Fernando Alfaro
ClaustroDoctor en Ciencias Biológicas, mención Ecología, Pontificia Universidad Católica de Chile, Chile.
Líneas de investigación:
Ecología microbiana, ecología de ecosistemas terrestres, ciclos biogeoquímicos y cambio global, eco-genómica.
Dr. Victor Aliaga
ColaboradorDoctor en Genómica Integrativa, Universidad Mayor, Chile.
Líneas de investigación:
Aplicación de estrategias de biología computacional y bioinformática para el estudio de la regulación transcripcional bacteriana. Utilización de enfoques de biología de sistemas y análisis de redes para comprender mejor los mecanismos subyacentes y las interacciones en la expresión génica bacteriana.
Dra. Melissa Calegaro-Nassif
ClaustroDoctora en Ciencias Biomédicas, Universidad de Chile, Chile.
Líneas de investigación:
Autofagia, enfermedad de Alzheimer, neurodegeneración, bases genómicas de enfermedades neurodegenerativas y envejecimiento.
Dr. Juan Pablo Cárdenas
ClaustroDoctor en Biotecnología, Universidad Andrés Bello, Chile.
Líneas de investigación:
Genómica comparativa y filogenómica de microorganismos de la microbiota intestinal.
Dra. Francisca Cornejo
ColaboradorDoctora en Ciencias Médicas, Pontificia Universidad Católica de Chile, Chile.
Líneas de investigación:
Estudio de las células gliales en el contexto del desarrollo del cerebro y sus patologías inducidas por alteraciones en la expresión génica de proteínas reguladoras del neurodesarrollo.
Dr. Ricardo Fernández-Ramires
ColaboradorDoctor en Oncología Molecular, Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO), España.
Líneas de investigación:
Genética humana y medicina personalizada; caracterización genómica de tumores raros, familiares y hereditarios a través de secuenciación masiva.
Dr. Nathan Johnson
ColaboradorDoctor en Biología de Plantas, Penn State University, Pennsylvania, EE.UU.
Líneas de investigación:
Desarrollo de herramientas bioinformáticas para la anotación y caracterización de RNAs pequeños en plantas y hongos. Función biológica de RNAs pequeños en plantas y hongos.
Dr. Carlos Maldonado
ColaboradorDoctor en Ciencias, mención Ingeniería Genética Vegetal, Universidad de Talca, Chile.
Líneas de investigación:
Desarrollo y aplicación de métodos de aprendizaje automático y bioinformática para el estudio de problemas genómicos y fenómicos en especies de interés agronómico y forestal.
Dra. Dinka Mandakovic
ClaustroDoctora en Ciencias Silvoagropecuarias y Veterinarias, Universidad de Chile, Chile.
Líneas de investigación:
Estudio de microorganismos y comunidades microbianas desde un punto de vista ecológico y genómico mediante herramientas de secuenciación masiva, bioinformáticas y experimentales tanto en laboratorio como en terreno.
Dr. Patricio Manque
ClaustroDoctor en Ciencias, Programa de Microbiología, Inmunología y Parasitología, Universidad Federal de São Paulo, Brasil.
Líneas de investigación:
Genómica, redes de interacción, neurodegeneración, bases genómicas de enfermedades neurodegenerativas y envejecimiento.
Dra. Andrea Miyasaka de Almeida
ClaustroDoctora en Biología Molecular, Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), Brasil.
Líneas de investigación:
Fisiología y genómica de árboles frutales, desarrollo y respuesta al ambiente en plantas.
Dr. Sebastián Morales
ColaboradorDoctor en Ciencias Biomédicas, Universidad de Chile, Chile.
Líneas de investigación:
Identificación de nuevos genes o variantes genéticas específicas de nuestra población que se asocien al riesgo de desarrollar cáncer utilizando herramientas de estudios genómicos como NGS y análisis funcionales de variantes genéticas clínicamente relevantes.
Dr. Consuelo Olivares
ColaboradorDoctora en Ciencias Biológicas, mención Genética Molecular y Microbiología, Pontificia Universidad Católica de Chile, Chile.
Líneas de investigación:
Estudio de la interacción entre hongos a través de estrategias de biología de sistemas (Dual RNAseq, sRNA RNAseq). Metabolismo de nitrógeno en hongos.
Dr. Gonzalo Olivares
ColaboradorDoctor en Ciencias Biológicas, mención Biología Celular y Molecular, Pontificia Universidad Católica de Chile, Chile.
Líneas de investigación:
Procesamiento de mRNAs y su efecto en comportamientos complejos como ciclo circadiano; genética cuantitativa de poblaciones; variación genética y sus consecuencias en enfermedades neurodegenerativas como Parkinson; variación genética y sus consecuencias en su interacción con el ambiente tal como la nutrición; diferenciación de células troncales adultas de la línea germinal; utilización de Drosophila melanogaster como modelo animal.
Dra. Camila Pereira
ColaboradorDoctora en Ciencias Biomédicas, Universidad de Chile, Chile.
Líneas de investigación:
Regulación epitranscriptómica de ARNs celulares y virales durante la infección de VIH-1 en distintas líneas celulares. Específicamente, el rol de la modificación post-transcripcional N6-metiladenosina (m6A) en ARNs no codificantes largos, ARNs mensajeros y ARNs virales que participan en distintas etapas del ciclo replicativo viral.
Dr. Sebastián Reyes Cerpa
ClaustroDoctor en Microbiología, programa conjunto Universidad de Santiago de Chile y Universidad de Chile, Chile.
Líneas de investigación:
Inmunología comparativa, regulación de la respuesta inmune en salmónidos y mecanismos de patogénesis.
Dr. Ignacio Retamal
ColaboradorDoctor en Ciencias Médicas, Pontificia Universidad Católica de Chile, Chile.
Líneas de investigación:
Estudio de bacterias intratumorales y modulación de inmunoterapia en cánceres orodigestivos, usando métodos de investigación clínica, inferencia causal y ómicas.
Dr. Jaime Rivas Pardo
ClaustroDoctor en Ciencias, mención Biología Molecular, Celular y Neurociencias, Universidad de Chile, Chile.
Líneas de investigación:
Mecano-fisiología del músculo cardiaco, mecano-transducción celular, elasticidad de adhesinas y péptidos anti-adhesivos.
Dra. Daniela Rivera
ClaustroDoctora en Ciencias Biológicas, mención Ecología, Pontifica Universidad Católica de Chile, Chile.
Líneas de investigación:
Ecología del comportamiento, fisiología ecológica, neurobiología y microbioma.
Dra. Nicole Trefault
ClaustroDoctora en Ciencias Biológicas, mención Genética Molecular y Microbiología, Pontificia Universidad Católica de Chile, Chile.
Líneas de investigación:
Microbiología ambiental, microbiología marina, microbiología de ambientes extremos, eco-genómica.
Dr. Leonardo Valdivia
ClaustroDoctor en Ciencias, mención Biología Molecular, Celular y Neurociencias, Universidad de Chile, Chile.
Líneas de investigación:
Desarrollo del sistema visual en pez cebra.
Dra. Elena Vidal
ClaustroDoctora en Ciencias Biológicas, mención Genética Molecular y Microbiología, Pontificia Universidad Católica de Chile, Chile.
Líneas de investigación:
Redes regulatorias de la respuesta al ambiente en plantas.
Dr. René Vidal
ClaustroDoctor en Ciencias, mención Biología Celular y Molecular, Universidad Austral, Chile.
Líneas de investigación:
Neurodegeneración, desarrollo de alternativas terapéuticas, bases genómicas de enfermedades neurodegenerativas y envejecimiento.
Dra. Ute Woehlbier
ClaustroDr. rer. nat., Universidad de Heidelberg, Alemania
Líneas de investigación:
Bases genómicas de enfermedades neurodegenerativas y envejecimiento.
Admisión
Fechas de postulación
Vacantes
Sistema de selección
Requisitos
Desde: 01-06-2024
Hasta 30-09-2024
10 estudiantes por cohorte
- Consiste en la evaluación de los antecedentes académicos presentados por el postulante (60% de la nota final), además de un examen de admisión (40% de la nota final).
- Antecedentes Académicos: Currículum vitae (según formulario de postulación) (50%), calificaciones de pregrado y/o ranking (40%), dos cartas de recomendación (10%)
- Examen de Admisión: Presentación de un artículo científico frente al Comité Académico del programa (30%), entrevista con miembros del Comité Académico del programa (40%), examen escrito (30%)
- Formulario de postulación.
- Copia simple o legalizada del grado académico o título profesional en el área de Biotecnología, Biología, Bioquímica, Medicina o formación equivalente.
- Fotocopia de cédula de identidad o pasaporte, por ambos lados.
- Dos cartas de recomendación.
- Certificado de notas de estudios de pregrado.
- Certificado de ranking de estudios de pregrado (si la institución no lo otorga, es necesario incluir un documento oficial generado por la Institución que indique la inexistencia de éste).
- Certificado de grado académico de estudios de postgrado (si tiene).
Dirección del Programa
Director
Comité Académico
Dr. J. Andrés Rivas
- Dr. Fernando Alfaro
- Dra. Melissa Calegaro-Nassif
- Dra. Dinka Mandakovic
- Dra. Ute Woehlbier
Contacto
Alejandra León Ortega
+56 2 23281372 | Camino La Pirámide N°5750, Huechuraba.
